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Phylogeography

Phylogeography 개인의 현대 지리 배급에 책임 있을지도 모른다 역사적인 과정의 학문은 이다. 이것은 a와 관련되었던 본에 비추어 개인의 지리 배급을 고려해서 달성된다 유전자 계통학.^[1] 이 기간은 지리적으로 구축된 유전 신호를 내의의 사이에서 기술하기 위하여 소개되고 종. 에 명백한 초점 종 생물지리학고아한은 그렇다 하고 세트 phylogeography 지나서 /biogeographical 집단 유전학 그리고 phylogenetics.^[2] 추정될 수 있는 사건 지나서 인구 확장을 포함하십시오, 인구는 좁아진다, vicariance 그리고 이동. 통합하는 최근에 개발된 접근 coalescent 이론 또는 대립 유전자와 분포상 정보의 계도 역사는 주소를 최신 패턴 형성에 있는 이 다른 역사적인 힘의 관계되는 역할 더 정확하게 통조림으로 만든다.^[3]

발달

기간 phylogeography가 1987년에 동안 처음으로 화폐로 주조되는,^[4] 그것은 매우 오랫동안을 위한 학과목으로 존재했다. 역사적인 지질의, 기후상과 생태학적인 조건이 종의 현재 배급을 좌우한 방법 역사적인 생물지리학 주소. 역사적인 생물지리학의 한 부분으로, 연구원은 유기체 년의 지리 및 진화 관계를 전에 평가하고 있었다. 1960 년대 및 1970 년대 동안에 2개의 발달은 현대 phylogeography를 위한 기반을 닦기에 특히 중요했다; 첫번째 퍼짐의이었다 cladistic 생각 및 제2는 발달의이었다 플레이트 텍토닉스 이론.^[5] 사고 체계 유래 강의 대륙 또는 대형의 따로따로 편류 같이 지질 사건을 통해 새로운 계보의 근원을 설명한 vicariance 생물지리학이었다. 연속 모집단 (또는 종 새로운 강 또는 새로운 산맥 (i.e, vicariance 사건)에 의해) 분할될 때, 2명의 인구 (또는 종) 창조된다. 고지리학, 지질학 그리고 paleoecology phylogeographic 분석으로 통합 인 정보를 공급하는 아주 중요한 분야는 이다.

Phylogeography는 a를 가지고 간다 집단 유전학 그리고 계통 발생 위에 원근법 생물지리학. 1970 년대 중반에서는, 인구 유전 분석은 미토콘드리아 감적으로 돌았다.^[6] 의 출현 폴리메라이제 연쇄 반응 (PCR), DNA 세그먼트의 사본의 수백만이 복제될 수 있는 과정은, phylogeography의 발달에서 결정적이었다. 이 돌파구에 감사는, 미토콘드리아 DNA 순서에서 포함된 정보 접근 가능했던 훨씬 더이었다. 두 실험실 방법 전부에 있는 전진 (예를들면. 모세관 DNA 연속 자료의 더 나은 사용을 만드는 컴퓨터 방법 및 더 쉬운 연속 DNA 을 허용한 기술) (예를들면. 고용 coalescent 이론) phylogeographic 추정을 개량하는 것을 도왔다.^[6].

이른 phylogeographic 일은 그것의 이야기 성격 그리고 부족을 위해 최근에의 강평되었다 통계 엄함 (i.e. 그것은 통계적으로 양자택일 가설을 시험하지 않았다). 유일하게 진짜 방법은 이었다 알랜 Templeton's는 지리적인 거리와 유전 relatedness 사이 일치 설명에 있는 주어진 과정의 타당성을 결정하기 위하여 추정 열쇠를 사용한 Clade 분석의 보금자리를 지었다. 최근 접근은 phylogeography에 처음에 행해졌다 보다는 더 강한 통계적인 접근을 채택했다.^{[7] [8] [2]}

보기

과거 2.4 백만 년의 빙하 작용 주기와 같은 기후 변화는 계속 분리된 refugia로 정기적으로 어떤 종을 제한한다. 이 제한되는 범위는 안으로 유래할지도 모른다 인구는 좁아진다 저것은 유전 변이를 감소시킨다. 일단 기후 변화에 있는 역분개가 refugial 지역에서 급속한 이동을, 이 종은 새롭게 유효한 서식지로 급속하게 퍼진다. 다수 실험적인 학문은 refugia와 후빙기 확장의 이 대본을 지원하는 동물과 식물 둘 다 종의 유전 서명을 찾아낸다.^[3] 이것은 둘 다 열대에서 생겼다^[9][10] 빙하에 의해 좌우된 온화한 지구 뿐만 아니라.^[11]

Phylogeography와 보존

Phylogeography는 보존을 위해 고가의 지역의 prioritization에서 도울 수 있다. Phylogeographic 분석은 또한 정의에 있는 중요한 역할을 했다 진화 뜻깊은 단위 (ESU), 유일한 지리 배급 및 미토콘드리아 유전 본에 수시로 정의되는 종의 밑에 보존의 단위는 수평하게 한다.^[12]

위태롭게 하는 굴에 최근 학문 가재 에서 애팔래치아 산맥 동부쪽 북아메리카의^[13] 지리 배급과 함께 계통 발생 분석이 어떻게 보존 우선권지 인식을 보조할 수 있는지 설명한다. phylogeographical 접근을 사용하여, 저자는 단 하나의 생각된 무슨이 안에 저것을 숨겨지, 넓게 분배된 종이고 고대 찾아내고 이전에 미결 종은 또한 출석했다. 보존 결정은 지금 두 계보 다 보호를 받았다는 것을 보증하기 위하여 할 수 있다. 이것 같이 결과는 phylogeographic 학문에서 드문 결과가 아니다.

분석의 salamanders 속의 Eurycea, 그룹의 현재 분류학이 중대하게 종 수평 다양성을 과소평가했다는 것을 것을이 또한 발견되는 애팔래치아 지방 사람에서.^[14] 이 학문의 저자는 또한 phylogeographic 다양성의 본이 지구의 배수장치 본에 있는 메이저 교대가 이 salamanders의 다양성의 발생에 있는 중요한 역할을 했다는 것을 나타내는 역사 (보다는 오히려 현대) 배수장치 연결과 좀더 연관되었다는 것을 것을이 발견했다. phylogeographic 구조의 철저한 이해는 이렇게 보존을 위한 우선순위를 매긴 지역에 있는 정보통 선택을 허용할 것이다.

비교 phylogeography

비교 phylogeography의 분야는 계통 발생 관계 그리고 배급에의 책임있는 기계장치를 설명하는 것을 노력한다 다른 종. 예를 들면, 다수 taxa의 맞은편에 비교는 생물 지리학 지구의 역사를 명백하게 할 수 있다.^[15] 예를 들면, 에 지구 등뼈동물의 phylogeographic 분석 Baja California 반도^[16] 그리고 반도의 태평양 그리고 만 측 둘 다에 바다 물고기^[15] vicariance 사건을 건의하는 전시 유전 서명은 동안에 다수 taxa에 영향을 미쳤다 홍적세 또는 Pliocene.

Phylogeography는 또한 지역 사회 구성에 중요한 역사적인 안목을 준다. 역사는 2가지의 방법에 있는 지역과 현지 다양성에 관련되다.^[9] 지역 종의 1개, 크기 및 메이크업은 균형에서 결과를의 합동한다 종형성 그리고 멸종. 현지 수평 지역 사회 구성에 2개는, 종의 현지 멸종 사이 상호 작용에 의해' 인구와 recolonization 좌우된다.^[9] 오스트레일리아 젖는 열대에 있는 비교 계통 발생 접근은 종 배급과 다양성의 지역 본이 기후상 주기에 대응하는 현지 멸종 및 연속적인 recolonizations에 의해 크게 결정된ㄴ다는 것을 나타낸다.

인간 phylogeography

주요 기사: 최근 단 하나 근원 가설 그리고 Multiregional 가설

Phylogeography는 또한 우리의 자신의 종의 근원과 분산 본 이해에 유용하 증명했다, 인류. 1 차로 고대 인간 유물의 골격 유물의 관측 및 그들의 나이의 의견, 인류학자에 기초를 두어 인간 근원에 관하여 2개의 경쟁 가설을 제시했다. 첫번째 가설은으로 불린다 보충을 가진 밖으로 의 아프리카 마지막 확장 쟁탈하는 모형, 아프리카 전부 이전을 전치해 현대 인간 귀착되는 약 100,000 년 전에 직립원인 spp. 안으로 인구 유라시아 저것은 아프리카에서 해외이주의 더 이른 파의 결과이었다. multiregional 대본은 아프리카에서 최근 확장에서 개인이 고대 아프리카 해외이주의 그 인구와 유전으로 섞었다는 것을 주장한다. a를 폭로한 phylogeographic 학문 미토콘드리아 이브 저것은 전에 아프리카에서 밖으로 의 아프리카 모형을 위한 제공한 이른 지원 150,000 년 살았다.^[17] 이 학문에는 그것의 결손이 있는 동안, 과학 원형과 광범위한 청중 내의 둘 다 뜻깊은 주목을 받았다. 단 하나 미토콘드리아 감적 대신에 10개의 다른 유전자를 이용한 더 철저한 phylogeographic 분석은 처음 범위 연장 후에 아프리카에서 적어도 2개의 중요한 확장의 나타낸다 직립 원인 현대 인간 유전자 총체를 형성하는 중요한 역할을 하고 저 재발하는 유전 교환은 퍼진다.^[18] 이 발견은 강하게에 있는 아프리카의 중추적인 역할을 설명했다 발전 현대 인간의, multiregional 모형에는 약간 타당성이 있었다는 것을 또한 나타내는.

바이러스의 Phylogeography

바이러스는 그들의 급속한 돌연변이 비율 및 빠른 생성 시간 때문에 진화 변화의 역동성 이해에서 유익하다.^[19] Phylogeography는 다른 바이러스성 긴장의 근원 그리고 배급 이해에 있는 유용한 툴이다. phylogeographic 접근은 인류 건강을 위협하는 많은 질병을 위해 채택되, 포함한 뎅그열, 광견병, 유행성감기 그리고 HIV.^[19] 유사하게, phylogeographic 접근은 아마 벡터 그리고 퍼짐의 이해에 있는 핵심 역활을 할 것이다 새 유행성감기 (HPAI H5N1), phylogeography의 관련성 일반 대중에 설명.

참고