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PubChem

PubChem ist a Datenbank von Chemikalie Moleküle. Das System wird durch beibehalten Nationale Mitte zu Biotechnologie-Information (NCBI), ein Bestandteil von Nationale Bibliothek von Medizin, das ein Teil der Vereinigten Staaten ist Nationale Institute der Gesundheit (NIH). PubChem kann für freies durch a erreicht werden NetzBenutzerschnittstelle. Millionen der zusammengesetzten Strukturen und der beschreibenden Datensätze können über frei downloadet werden Ftp. PubChem enthält Substanzbeschreibungen und kleine Moleküle mit weniger als 1000 Atomen und 1000 Bindungen. Amerikanische chemische Gesellschaft versucht, zu erhalten US Kongreß den Betrieb von PubChem einzuschränken, weil sie ihn behaupten konkurriert mit ihrem Chemikalie entzieht Service.[1]. Mehr als 80 Datenbankverkäufer tragen zur wachsenden PubChem Datenbank bei.[2]

Inhalt

Datenbanken

PubChem besteht aus drei dynamisch wachsenden Primärdatenbanken:

  • Mittel, 18.4 Million Eintragungen, enthält die reinen und gekennzeichneten Chemikaliemittel. Überprüfen Sie die genaue Zahl Mitteln online.[3]
  • Substanzen, 38.6 Million Eintragungen, enthält auch Mischungen, Extrakte, Komplexe und uncharacterized Substanzen. Überprüfen Sie genaue Zahl der Substanzen online.[4]
  • Biologische Drogenerprobung, Bioaktivität Resultate von 598 Hochdurchsatz Siebung Programme mit einiges Million Werten. Überprüfen Sie genaue Zahl von biologischen Drogenerprobungen online.[5]

Suchen

Der Datenbanken zu suchen ist für eine ausgedehnte Strecke der Eigenschaften einschließlich chemische Struktur, Namensfragmente möglich, chemische Formel, Molekulargewicht, XLogPund Wasserstoffbindung Spender- und Akzeptorenzählimpuls.

PubChem enthält sein eigenes on-line Molekülherausgeber mit LÄCHELN/SMARTS und InChI stützen Sie sich, das den Import und den Export aller chemischen Formate Akte des Common zur Suche nach Strukturen und Fragmenten erlaubt.

Geschlagenes jedes stellt Informationen über Synonyme, chemische Eigenschaften, chemische Struktur einschließlich LÄCHELN und InChI Zeichenketten, Bioaktivität und Verbindungen zu strukturell bezogenen Mitteln und andere NCBI Datenbanken wie zur Verfügung PubMed.

In der Textsuchform, welche die Datenbank auffängt, kann indem das Hinzufügen des Feldnamens in den eckigen Klammern der Suchbezeichnung gesucht werden. Eine numerische Strecke wird durch zwei Zahlen dargestellt, die durch einen Doppelpunkt getrennt werden. Die Suchbezeichnungen und Feldnamen sind- Schachtel-unempfindlich. Klammern und logische Operatoren UND ODER und NICHT kann verwendet werden. UND wird angenommen, wenn kein Operator verwendet wird.

Beispiel (Richtlinie Lipinskis von fünf):

0:500 [mw] 0:5 [hbdc] 0:10 [hbac] -5:5 [logp]

Amerikanische chemische Gesellschaft-Interessen auf PubChem

Amerikanische chemische Gesellschaft hat ernste Interessen über die öffentlich gestützte PubChem Datenbank aufgeworfen, da sie scheint, mit ihrem Bestehen direkt zu konkurrieren Chemikalie entzieht Service. Sie haben ein starkes Interesse an der Ausgabe, da der chemische Auszüge Service einen großen Prozentsatz des Einkommens der Gesellschaft erzeugt. Um ihre Position gegen die PubChem Datenbank zu befürworten, hat ACS aktiv den US Kongreß beeinflußt. Sie werden berichtet, den beeinflussenden festen Hicks Partnern LLC $100.000 gezahlt zu haben mindestens 2005, um zu versuchen, Kongreßmitglieder, das NIH und das Büro des Managements und des Etats (OMB) gegen das Herstellen einer öffentlich finanzierten Datenbank zu überzeugen. Sie auch wurden berichtet, um aufgewendete $180.000 zu haben, zum von Wexler anzustellen u. verbindet Wanderer-allgemeine Politik, um den „Gebrauch von [a] kommerzieller Datenbank zu fördern.“

Datenbank fängt auf


Kennummern
Kennummer in der gegenwärtigen Datenbank [UID]
SubstanzKennummer [SID]
Zusammengesetzte Kennummer [CID]
DrogenerprobungKennummer [BAID], [HILFSMITTEL]

Allgemein
Jede mögliche Datenbank fangen auf [ALLE]
Anmerkung [CMT]
Absetzungdatum [DDAT], [DEPDAT]
Externe Identifikation des Galvaniseurs [SRID], [SRCID]
Quellname [SRC], [SRCNAM], [SRCNAME]
Quellfreigabedatum [SRD], [SRDAT], [RLSDAT]
Medizinische vorbehaltliche überschrift (Ineinandergreifen) Bezeichnung [MSHT], [MESHT]
Ineinandergreifenbaumnullpunkt [MSHN], [MESHTN]
Pharmakologische Tätigkeiten des Ineinandergreifens [PHMA], [PHARMA]

Substanzeigenschaften
Substanzsynonyme [SYNO]
IUPAC Name [UPAC], [IUPAC]
Internationaler chemischer Bezeichner (InChI) [INCHI]
Molekulargewicht [MW], [MWT], [MOLWT]
Chemische Elemente [ELMT], [EL]
Nicht-Wasserstoff Atome [HAC], [HACNT]
Isotop Zählimpuls [IAC], [IACNT]
Gesamtmenge formale Aufladung [TFC], [CHG], [CHRG]
Chiral Atomzählimpuls [AKKUMULATOR], [ACCNT]
Definierter chiraler Atomzählimpuls [ACDC], [ACDCNT]
Unbestimmter chiraler Atomzählimpuls [ACUC], [ACUCNT]
Wasserstoffbindung Akzeptor Zählimpuls [HBAC], [HBACNT]
Wasserstoffbondspenderzählimpuls [HBDC], [HBDCNT]
Tautomer Zählimpuls [TC], [TCNT], [TTMC]
Drehbarer Bondzählimpuls [RBC], [RBCNT]
XLogP [XLGP], [LOGP]

Zusammengesetzte Eigenschaften
Zusammengesetzte Synonyme [CSYN], [CSYNO]
Teilzählimpuls [CM], [CCNT]
Kovalenter Maßeinheit (Molekül) Zählimpuls [CUC], [CUCNT]
Gesamtbioaktivitätzählimpuls [TAC]

Sehen Sie auch

Externe Verbindungen

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